深圳內(nèi)資公司在注冊時需要的機構(gòu)包括工商局、稅務局等相關機構(gòu)，但是我們并不會在本文中對這些機構(gòu)進行詳解，而是主要介紹深圳內(nèi)資公司注冊的流程和注意事項。

首先，需要準備好以下資料：1、公司設立登記申請書； 2、公司章程； 3、法人股東資格證明或者自然人股東身份證及其復印件； 4、代理人身份證及其復印件； 5、住所使用證明。

其次，提交注冊申請和繳納注冊費用，注冊費用一般在500元左右。在提交申請時需要注意申請表格的正確填寫和資料的齊備性，以免因此耽誤注冊時間和產(chǎn)生一些不必要的麻煩。

然后，等待核名，這個過程需要等待工商部門的審批，一般需要3-5個工作日。核名的主要目的是為了保證公司的名稱符合法律規(guī)定，以避免重名或者存在侵權等問題。核名通過后，需要進行公司章程的制定和公證。在制定公司章程時需要考慮到當前和未來公司的業(yè)務范圍以及向股東分配利潤等重要方面。

最后，需要在工商等相關機構(gòu)完成營業(yè)執(zhí)照的領取和印章的刻制。在領取執(zhí)照之后需要前往稅務局進行稅務登記，以確保公司的合法操作。

總的來說，深圳內(nèi)資公司注冊并不是一個復雜的過程，但是由于包含多個環(huán)節(jié)，需要注意各個環(huán)節(jié)的準確性和時效性。另外，需要提醒大家的是，在注冊公司時注意選擇可靠的代理機構(gòu)，以避免出現(xiàn)一些不必要的糾紛和風險。