在深圳注冊的企業(yè)在進行記賬報稅時，需要登錄深圳海關記賬報稅系統(tǒng)。該系統(tǒng)是中國海關總署推出的一項電子服務，旨在方便企業(yè)進行報關業(yè)務和稅務申報，提高工作效率，減少人員和時間成本。

首先，企業(yè)需要在該系統(tǒng)上進行注冊，并按照要求填寫企業(yè)信息和相關證件資料。注冊成功后，企業(yè)就可以通過該系統(tǒng)進行登錄，并在上面進行相應的操作。

在進行記賬報稅時，企業(yè)需要將所有涉及到的收支情況和相關票據(jù)資料錄入系統(tǒng)。同時，企業(yè)還需要根據(jù)稅務部門要求的時間節(jié)點進行納稅申報。系統(tǒng)會自動計算企業(yè)所得稅和增值稅等各種稅收費用，并進行相應的抵扣。企業(yè)只需要按照系統(tǒng)提示進行付款即可。

需要注意的是，企業(yè)在進行記賬報稅時需嚴格遵守稅務部門的相關規(guī)定。如果出現(xiàn)操作上的失誤，可能會導致企業(yè)被罰款或出現(xiàn)其他不良后果。因此，對于不熟悉記賬報稅流程和規(guī)定的企業(yè)，建議尋找專業(yè)的會計師事務所或代理記賬公司進行處理，以確保遵守相關法規(guī)規(guī)定，從而避免稅務風險。

總的來說，在深圳進行記賬報稅需要使用海關記賬報稅系統(tǒng)，企業(yè)可以自行進行相關操作或選擇聘請會計師事務所或代理記賬公司進行。不論是自行操作還是聘請專業(yè)服務，都需要遵守相關規(guī)定，將企業(yè)的財務狀況和稅務申報做好，為企業(yè)的可持續(xù)發(fā)展提供支持。